一、長(zhǎng)時(shí)程觀察細(xì)胞遷移和生長(zhǎng)

激光掃描共聚焦顯微鏡光子產(chǎn)生效率已大大改善，與更亮的物鏡和更小光毒性的染料結(jié)合后可以減小每次掃描時(shí)激光束對(duì)細(xì)胞的損傷，用于數(shù)小時(shí)的長(zhǎng)時(shí)程定時(shí)掃描，記錄細(xì)胞遷移和生長(zhǎng)等細(xì)胞生物學(xué)現(xiàn)象。

二、三維圖像的重建

傳統(tǒng)的顯微鏡只能形成二維圖像，激光掃描共聚焦顯微鏡通過(guò)對(duì)同一樣品不同層面的實(shí)時(shí)掃描成像，進(jìn)行圖像疊加可構(gòu)成樣品的三維結(jié)構(gòu)圖像。 它的優(yōu)點(diǎn)是可以對(duì)樣品的立體結(jié)構(gòu)分析，能十分靈活、直觀地進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察,并揭示亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的空間關(guān)系。

三、細(xì)胞間通訊的研究

激光掃描共聚焦顯微鏡可通過(guò)觀察細(xì)胞縫隙連接分子的轉(zhuǎn)移來(lái)測(cè)量傳遞細(xì)胞調(diào)控信息的一些離子、小分子物質(zhì)。 該技術(shù)可以用于研究胚胎發(fā)生、生殖發(fā)育、神經(jīng)生物學(xué)、腫瘤發(fā)生等過(guò)程中縫隙連接通訊的基本機(jī)制和作用，也可用于鑒別對(duì)縫隙連接作用有潛在毒性的化學(xué)物質(zhì)。

四、在眼科研究中的應(yīng)用

利用激光掃描共聚焦顯微鏡可以觀察晶狀體，角膜、視網(wǎng)膜、虹膜和睫狀體的結(jié)構(gòu)和病理變化。

五、在血液病學(xué)和醫(yī)學(xué)免疫學(xué)研究中的應(yīng)用

激光掃描共聚焦顯微鏡觀察免疫細(xì)胞和系統(tǒng)，如樹(shù)突狀細(xì)胞、單核-吞噬細(xì)胞系統(tǒng)、自然殺傷細(xì)胞、淋巴細(xì)胞時(shí)，在準(zhǔn)確細(xì)胞定位的同時(shí)有效鑒定免疫細(xì)胞的性質(zhì)。

 六、組織和細(xì)胞中的定量熒光測(cè)定

激光掃描共聚焦顯微鏡可以從固定和熒光染色的標(biāo)本以單波長(zhǎng)、雙波長(zhǎng)或多波長(zhǎng)模式，對(duì)單標(biāo)記或多標(biāo)記的細(xì)胞及組織標(biāo)本的共聚焦熒光進(jìn)行數(shù)據(jù)采集和定量分析,同時(shí)還可以利用沿縱軸上移動(dòng)標(biāo)本進(jìn)行多個(gè)光學(xué)切片的疊加， 形成組織或細(xì)胞中熒光標(biāo)記結(jié)構(gòu)的總體圖像,以顯示熒光在形態(tài)結(jié)構(gòu)上的精確定位。